根据国际癌症研究所(IARC; International Agency for Research on Cancer)2020年统计基准,大肠癌被记录为发病率第三,死亡率第二的癌症。与胃癌一样,大肠癌在早期发现时,尽量想通过根治性切除手术达到痊愈,但如果在发展为进展性大肠癌的状态下被发现或复发时,将会成为传统的抗癌化学疗法的对象。传统的大肠癌治疗方针是根据TNM病理分类法来进行,但随着肿瘤分子生物学技术的发展,进行了各种各样的大肠癌分子压型的研究,同时,也在试图证明其临床有效性。
大肠癌分子压型研究中最有名的要数共识分子压型了(Consensus Molecular Subtype, CMS)。此分子压型是从多样的基因表达平台和多样的肿瘤类型(FFPE标本及新鲜冷冻标本)中,分析了大规模的数据集(n = 4151),从而导出了遗传性后性遗传及传达信号途径各不相同的4个分子压型。
Type | % | Characteristics |
---|---|---|
CMS1 (microsatellite instability immune) | 14% | hypermuted, MSI high (along with CIMP+ phenotype with BRAF frequently mutated), low Somatic Copy Number Alteration, immune infiltration |
CMS2 (canonical) | 37% | high Somatic Copy Number Alteration, microsatellite stable, activated WNT & Myc pathway, elevated EGFR with the mutated TP53 gene |
CMS3 (metabolic) | 13% | hypermutated, moderate/low MSI and intermediate CIMP status, elevated multiple metabolic signatures, moderately activated WNT/Myc signaling pathway along with mutated KRAS, PIK3CA, and overexpressed IGBP3 |
CMS4 (mesenchymal) | 23% | remarked upregulation of gene involved in EMT transition, matrix remodeling pathway, stromal invasion and angiogenesis, prominent TGFβ signaling, and inflammatory-related system |
Guinney, J., Dienstmann, R., Wang, X. et al. The consensus molecular subtypes of colorectal cancer. Nat Med 21, 1350–1356 (2015). https://doi.org/10.1038/nm.3967
有关此类的异质性的标准是努力定义各项CMS分子压型靶向疗法中的一环。CMS1具有较高的MSI和免疫细胞侵入相关的免疫关卡免疫剂,CMS2和CMS3具有改变体细胞拷贝数(SCNA)及根据基因突变相关的靶向化疗,CMS4是依靠TGF β信号传播途径的非正常活性化,来促进相关的上皮间质转化(Epithelial-mesenchymal transition, EMT)。
NOVOMICS在开发nProfiler® 1过程中获得的基因网络的理解和产品商用化经验,应用对大肠癌分子压型研究。特别是,在EMT被通指为在胃癌,大肠癌,结肠癌中惯用的不良预后特性的这一观点来看,在胃癌及结肠癌中观察到的转录性EMT行动及TGFβ抑制剂作用的理解,也希望扩展到大肠癌分子压型分类技术中。